WRFをコンパイルするために、できるだけ最新のnetcdfを
同じPATHにインストールする必要があった。
前提として、Centos7もしくはCentos8で、
dnf install epel-release dnf install netcdf dnf install netcdf-fortran
がインストールされている状況であることを記載しておく。
もっと最新のものをいれたいが、HDF5,zlib,szip,jpeglibは
既存のものを使うという前提がここにはある。上記のインストール時に
HDFなどは一緒にインストールされる。
ソースプログラムを以下のURLからダウンロード
https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/
netcdf-c-4.8.1 のインストール
インストール先を
/home/shimizus/INST_WRF/netcdf とする。
./configure --prefix=/home/shimizus/INST_WRF/netcdf
とし、 特に環境変数などの設定はしないで実行した。
make make install
として、インストールが無事に成功した。
netcdf-fortran-4.5.3 のインストール
次にnetcdf-fortranをインストールする。既存の古いnetcdf-cを
読み込んでしまうと、バージョンが4.7.4以下のnetcdf-cだと
インストールができないので、以下の通りに環境変数を先程インストールした
最新のnetcdf-cを指定する必要がある。ここで忘れてはいけないのは、netcdf-cには
共有ライブラリーも含まれているので、LD_LIBRARY_PATHの追加もしておく必要がある。
setenv FC gfortran
setnev F77 gfortran
setenv LDFLAGS "-L/home/shimizus/INST_WRF/netcdf/lib"
setenv LIBS "-lnetcdf"
setenv CPPFLAGS "-I/home/shimizus/INST_WRF/netcdf/include"
setenv LD_LIBRARY_PATH ${LD_LIBRARY_PATH}:/home/shimizus/INST_WRF/netcdf/lib
上記設定後、
./configure --prefix=/home/shimizus/INST_WRF/netcdf make make install
として、netcdf-cとnetcdf-fortranを同じ場所にインストールした（WRFの仕様）